Marek Šedivý je prezidentem AVPO ČR od jejího vzniku v roce 2010. Současně je viceprezidentem Sekce nestátních neziskových organizací Unie zaměstnavatelských svazů ČR a členem Výboru pro legislativu a financování Rady vlády pro nestátní neziskové organizace.
V roce 2015-2018 pracoval jako ředitel Nadačního fondu Dům Ronalda McDonalda, v letech 2000-2013 vedl obecně prospěšnou společnost Neziskovky.cz.
Je spoluautorem knih zaměřených na management neziskových organizací a publikuje v odborném tisku.